Nuestra historia comienza en la región de passio con el objetivo de hacernos con el título del World Master, y detener las fechorías de un malvado equipo de villanos que amenazan la paz.
Pokémon master ex es un juego de aventuras y combates 3vs3 donde podremos ver todos los personajes de la serie haciéndonos sus compis (compañeros) e ir reclutandolos a nuestro equipo para avanzar en las misiones ya que debemos elegir a dos acompañantes para los duelos, comenzaremos nuetro recorrido con misty y brock a medida que avancemos iremos conociendo más personajes.
Lo que hace diferente este juego de los otros es que está en español y aunque no lo parezca es difícil vencer a los jefes en los eventos lo que hace que sea un verdadero Reto, podemos conseguir pokemones Legendarios y gemas en el trayecto de las misiones.
área de entrenamiento: aquí podemos subir de nivel ,mejorar nuestras habilidades de combate, huevos para eclosionar y conseguir piedras evolutivas.
episodios compis: es donde podemos interactuar con nuestros compañeros de combates ayudándolos en ocasiones para evolucionar sus PKMN.